A FCMS/JF conta com hospital próprio, o Hospital e Maternidade Therezinha de Jesus – HMTJ para o ensino. Hospital de referência regional, é equipado com centro cirúrgico, berçário, estrutura de médicos plantonistas e intensivistas. Faz atendimento ambulatorial de nível secundário, fornecendo excelente campo de prática, inclusive na fase do estágio supervisionado.
O sistema de referência e contrarreferência obedece à lógica da gestão plena do município de Juiz de Fora. Assim, assumindo o HMTJ, a FCMS/JF tem o compromisso de colaborar com a melhoria deste sistema assegurando a integralidade da atenção e a resolubilidade dos problemas existentes, permitindo que o estudante participe do atendimento ambulatorial desde a UBS acompanhando o paciente que seja referido ao Hospital.
